คนทั่วไปนำถั่วแระญี่ปุ่นมาต้มก่อนนำมารับประทาน แต่การต้มนั้นค่อนข้างยุ่งยากกว่า การใช้ไมโครเวฟจึงเป็นทางเลือกใหม่ในการต้มถั่วแระญี่ปุ่น การใช้ไมโครเวฟทำให้ถั่วสุกมีข้อดีเหนือการต้มคือ รสชาติของถั่วแระญี่ปุ่นจะหวานอร่อยมากขึ้น ไม่สูญเสียคุณค่าทางอาหารเหมือนการต้ม ถั่วแระไม่เละหรือแข็งจนเกินไป และไม่ต้องใช้ภาชนะมากมายจึงไม่ต้องเสียเวลาล้าง วิธีการนำถั่วแระมาทำให้สุกโดยใช้ไมโครเวฟมีดังนี้คือ
1. ล้างถั่วแระ 200 กรัมจนสะอาด และวางให้สะเด็ดน้ำบนตะแกรง
2. โรยเกลือ 1 ช้อนชา บนถั่วแระแล้วใช้มือคลุกเคล้าให้ทั่ว
3. นำถั่วใส่ภาชนะทนร้อนและปิดด้วยพลาสติกแรป นำเข้าไมโครเวฟที่ 600 วัตต์ เป็นเวลา 2 นาที
4. นำภาชนะออกมาจากไมโครเวฟ ใช้ส้อมหรือตะเกียบพลิกกลับด้านถั่ว (ขั้นตอนนี้ต้องระวังอย่าให้ไอร้อนลวกมือ) ปิดด้วยพลาสติกแรปและนำเข้าไมโครเวฟที่ 600 วัตต์ ต่ออีก 2 นาที
5. นำถั่วแระญี่ปุ่นเทลงในตะแกรงเพื่อให้ของเหลวผ่านออกไป วางไว้จนเย็นก็สามารถนำมารับประทานได้ตามชอบ
เมืองไทยอาจจะหาซื้อถั่วแระญี่ปุ่นต้มสุกแช่แข็งได้ง่ายกว่าถั่วแระดิบ วิธีการนำถั่วแระญี่ปุ่นแช่แข็งมารับประทานให้อร่อยนั้นทำได้โดยนำถั่วแระแช่แข็งประมาณ 160 กรัมมาละลายน้ำแข็งโดยนำเข้าไมโครเวฟที่ 600 วัตต์ เป็นเวลา 50 วินาที หรืออาจจะปล่อยให้ละลายตามธรรมชาติในตู้เย็นก็ได้